Flybaboo reliera 12 fois par semaine Genève à Nice dès le 21 mars venant ainsi concurrencer Easyjet, désormais seul transporteur sur cette ligne.
Toutefois Flybaboo vise plutôt une clientèle d’hommes d'affaires grâce à des prestations et des horaires plus adaptés. La compagnie propose même la prise en charge d'enfants non accompagnés et le transport d'animaux de compagnie. Son objectif est de gagner une part de marché de 12 % à 13 %. En 2003, la fréquentation de la ligne était tombée à 269.886 passagers avec le retrait de Swiss puis à 251.820 passagers en 2004 avec Easyjet. L’arrivée de Flybaboo devrait permettre à l'axe Nice-Genève de retrouver son niveau de 300.000 passagers annuels.
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